او در نامه استعفایش نوشت: ترکیه امروز نیاز دارد که تلاش‌های جدیدی برای آینده‌اش شروع کند و من و بسیاری از دوستانم برای چنین تلاشی یک مسوولیت بزرگ و تاریخی احساس می‌کنیم. من معتقدم که راه‌حل مشکلات پیش‌روی ما تنها از طریق گسترش طیف نمایندگی برای مردم ما ممکن خواهد بود. وی در ادامه خاطرنشان کرد: این اهمیت زیادی دارد که ما برای آینده کارمان را مستقل و آزاد انجام دهیم. او همچنین گفت: متاسفانه برای من دیگر مقدور نیست که به کارم به‌عنوان یکی از اعضای پایه‌گذار حزب عدالت و توسعه ادامه دهم و امروز استعفایم را به مقامات حزب تحویل دادم. باباجان تاکید کرده است: تحت این شرایط ترکیه به دیدگاه تازه‌ای برای آینده نیاز دارد، به تحلیل‌های صحیح در تمامی عرصه‌ها، استراتژی‌های جدید توسعه، طرح‌ها و برنامه‌هایی برای کشور. آغاز تلاش‌هایی تازه برای امروز و آینده ترکیه ضروری است. بسیاری از همکاران و من مسوولیت بزرگ و تاریخی برای انجام این تلاش‌ها احساس می‌کنیم.