وزارت نیرو با هدف گذر از کمیت به کیفیت و ارتقای سطح خدمات و سرعت بخشیدن به اجرای طرح‌ها‌، به‌ویژه طرح‌های آبرسانی روستایی، پس از بررسی‌های کارشناسی، برنامه یکپارچه‌سازی شرکت‌های آب و فاضلاب شهری و روستایی در استان‌ها را با سازماندهی مجدد ساختار اداری بخش آب و فاضلاب به‌منظور استفاده بهتر از امکانات موجود، منابع انسانی و منابع مالی، تدوین و از سال ۱۳۹۱ در دستور کار قرار داد. در نهایت در سال ۱۳۹۸ با استفاده از ظرفیت‌های قانونی موجود و با مصوبه شورای‌عالی اداری و تصویب‌نامه هیات‌وزیران، یکپارچه‌شدن شرکت‌های آب و فاضلاب شهری و روستایی وارد فاز اجرایی شد. در حالی‌‌که تا پیش از اجرای برنامه مزبور هر کدام از شرکت‌های آب و فاضلاب شهری و روستایی به سبب ساختار جداگانه‌ مدیریت و راهبردهای متفاوت و متاثر از میزان اعتبارات و امکانات فنی، طرح‌هایی را مطالعه و اجرا می‌کردند؛ یکپارچه‌سازی شرکت‌های آب و فاضلاب شهری و روستایی، مدیریت توامان امور مربوط به خدمات آب و فاضلاب در بخش شهری و روستایی و مدیریت یکپارچه تامین و توزیع آب و حذف فعالیت‌های موازی را در دسترس مدیران شرکت‌ها قرار داد و زمینه‌ تسهیل و ارتقای خدمات به‌ویژه به مشترکان بخش روستایی را فراهم کرد.  در پی اجرای برنامه یکپارچه‌سازی، تعداد مراکز خدمت به روستاییان در شهرها بالغ بر ۱۲۴۰ واحد شده که نسبت به وضعیت قبل از اجرای برنامه‌ مزبورحدود ۳ برابر شده است. استفاده از منابع تامین آب مشترک، مخازن مشترک و خطوط انتقال مشترک ظرفیت‌های متقابل زیادی را هم برای شهرها و هم برای روستاها ایجاد کرده است‌‌ به‌ طوری‌که در سال اول اجرای یکپارچه‌سازی شرکت‌های آب و فاضلاب، در سطح کشور بدون ایجاد تاسیسات جدید و با بهره‌گیری از پتانسیل‌های موجود، امکان تامین آب بیش از ۵۰۰ هزار متر‌مکعب در شبانه‌روز حاصل شده و بیش از ۲ میلیون نفر از آثار این هم‌افزایی بهره‌مند شده‌اند. هم‌اکنون در تمام شرکت‌های آب و فاضلاب، آزمایش‌های بیولوژیکی، شیمیایی و ریزآلاینده‌ها بدون محدودیت و به‌صورت یکسان برای آب مورد‌استفاده مشترکان مناطق شهری و روستایی قابل انجام است. ظرفیت‌های ایجاد‌شده نقش بسیار مهمی در کنترل و پایش مستمر کیفیت آب مناطق روستایی به‌همراه دارد. آثار و نتایج اجرای برنامه در سال اول امیدها برای حرکت شتابان در اجرای طرح‌های صنعت آب و فاضلاب در مناطق روستایی را دو‌چندان کرده ‌و بیش از هر زمان دیگری رفع تبعیض و ارائه همگون خدمات آب و فاضلاب به آحاد جامعه نزدیک‌ به واقعیت شده است.