کوهن مدعی شد که شهید فخری‌زاده در پروژه‌ای فعالیت داشت که خاورمیانه و تمام جهان را به خطر می‌انداخت. وزیر اطلاعات رژیم صهیونیستی مدعی شد: «برای ما روشن است که ایران با تمام توان تلاش خود را خواهد کرد تا‌ به سلاح هسته‌ای دست یابد، اما اسرائیل هیچ گاه به آن اجازه نمی‌دهد که این کار را انجام دهد.» همزمان بنیامین نتا‌نیاهو، نخست‌وزیر رژیم صهیونیستی در واکنش به ترور شهید محسن فخری‌زاده و متهم بودن این رژیم در این عملیات، اظهاراتی فرافکنانه را مطرح کرد. به گزارش «ایسنا» به نقل از روسیا الیوم، نتا‌نیاهو در یک سخنرانی در اندیشکده هادسن که از طریق ویدئو‌کنفرانس برگزار شد در پاسخ به سوالی در رابطه با متهم کردن رژیم صهیونیستی در ترور محسن فخری‌زاده از سوی مقامات ایران مدعی شد: آنها همیشه ما را متهم می‌کنند، حالا چه درست باشد چه غلط! وی ادعا کرد: «در مورد هر چیزی که در ایران رخ بدهد ما را متهم می‌کنند و سیاست ثابت ما اقتضا می‌کند که در مورد چنین مسائلی نظر ندهم؛ بنابراین اکنون این کار را انجام نخواهم داد.» از سوی دیگر جوزپ بورل، مسوول سیاست خارجی اتحادیه اروپا اظهار کرد که ترور دانشمند ایرانی «سختی‌هایی» را در مسیر احیای توافق هسته‌ای با ایران ایجاد می‌کند. به گزارش «ایسنا» بورل، روز پنج‌شنبه در گفت‌وگویی با یورونیوز درخصوص ترور شهید محسن فخری‌زاده گفت: «واضح است که این کار کمکی نمی‌کند. هر کس این کار را انجام داده به‌دنبال تشدید تنش‌ها بوده است.» همچنین سی‌ان‌ان به نقل از بایدن نوشت «سخت است بگوییم که تا‌ چه حد» ترور محسن فخری‌زاده تعاملات وی با ایران را سخت‌تر خواهد کرد. در عین حال نماینده ویژه آمریکا در امور ایران و ونزوئلا گفت که احتمالا ایران تا‌ سرکار آمدن جو بایدن، رئیس‌جمهور منتخب آمریکا از اقدام برای گرفتن انتقام ترور محسن فخری‌زاده، دانشمند هسته‌ای ایرانی خودداری کند و تا‌ آن زمان اقدامی نکند. به گزارش «ایسنا»، الیوت آبرامز، نماینده ویژه ایالات‌متحده در امور ایران و ونزوئلا شامگاه پنج‌شنبه در گفت‌وگو با خبرگزاری رویترز با بیان اینکه ایران نیاز به کاهش تحریم‌های آمریکایی اعمال شده بر این کشور دارد، گفت: «این موضوع به ویژه تا‌ انتقال قدرت از دونالد ترامپ به جو بایدن در ۲۰ ژانویه به‌عنوان عنصری اساسی در اتخاذ هر گونه تصمیمی برای واکنش به کشته شدن دانشمند هسته‌ای ایران نقش خواهد داشت.»

همچنین در ادامه واکنش‌های ایران به ترور شهید فخری‌زاده، نماینده دائم ایران نزد دفتر سازمان ملل در ژنو، با ارسال نامه‌ای به مدیرکل سازمان جهانی بهداشت، با اشاره به ترور شهید فخری‌زاده، بر ضرورت واکنش قاطع جامعه بین‌المللی نسبت به این «نخبه‌کشی» رذیلانه تا‌کید کرد. به گزارش خبرگزاری فارس، اسماعیل بقایی هامانه نماینده دائم جمهوری اسلامی ایران نزد دفتر سازمان ملل در ژنو، با ارسال نامه‌ای به «تدروس آدهانوم» مدیرکل سازمان جهانی بهداشت، ضمن تشریح خدمات ارزنده این پژوهشگر برجسته در حوزه بهداشت و درمان، از جمله در زمینه تولید اولین مجموعه از کیت‌های تشخیص کرونا در ایران و همچنین مدیریت پروژه تولید واکسن کووید-۱۹، ترور سبعانه وی را در ادامه سیاست فشار همه‌جانبه بر ملت ایران توصیف و تا‌کید کرد: «سکوت و بی‌عملی در برابر این آدمکشی به هیچ عنوان جایز نیست؛ چراکه باعث عادی شدن و تکرار چنین جنایاتی در اقصی نقاط جهان خواهد شد.»