در پی درج خبری با عنوان «نامه بقایی به ترکان» در رسانه‌های کشور، اکبر ترکان مشاور رییس‌جمهور و دبیر شورای هماهنگی مناطق آزاد و ویژه اقتصادی کشور به موارد منتشر شده در این نامه پاسخ داد. به گزارش پایگاه خبری مناطق آزاد و ویژه اقتصادی در این نامه خطاب به بقایی آمده است: احتراما بازگشت به مرقومه جنابعالی در خصوص نکاتی که در مصاحبه اینجانب با شبکه پنج سیمای جمهوری اسلامی ایران مطرح شده است، نظر جنابعالی را به مستندات زیر معطوف می‌دارد: در مورخ ۲۶/۳/۱۳۹۲ طی تصویب‌نامه‌ای، حق بهره‌برداری از یک باب ساختمان سازمان منطقه آزاد قشم واقع در خیابان گاندی به مساحت زیربنای ۶۷۵ متر مربع به نهاد ریاست‌جمهوری واگذار می‌شود. در مورخ ۱۹/۴/۱۳۹۲ طی تصویب‌نامه دیگری حق بهره‌برداری از همان ساختمان به همراه دو پلاک از ساختمان‌های سازمان منطقه آزاد چابهار واقع در خیابان ستاری هر کدام به مساحت ۹۶۳ مترمربع (جمع زیربنای دو ساختمان سازمان چابهاربه مساحت ۱۹۲۶ مترمربع) و به مدت ده سال به خانه ایرانیان خارج از کشور واگذار می‌شود. اتخاذ تصمیمات فوق در فرصت جابه‌جایی دولت و استقرار دولت جدید و با اطلاع از انتقال بار این تصمیمات به دولت جدید صادر شده است.در ادامه آمده است: به‌رغم واگذاری حق بهره‌برداری ساختمان‌های مذکور طی تصویب‌نامه فوق به خانه ایرانیان و از آنجا که واگذاری حق بهره‌برداری توسط هیات دولت صورت گرفته و امکان تغییر بهره‌بردار پس از استقرار دولت جدید وجود دارد، شیوه‌ای جدید اتخاذ شده و هر سه ساختمان یاد شده طی قراردادهای اجاره‌ای از طرف سازمان‌های مناطق آزاد قشم و چابهار به مدت ده سال به موسسه خانه ایرانیان واگذار شده است. گرچه تصویب‌نامه دیگری در مورخ ۲۶/۳/۱۳۹۲ توسط دولت صادر و مقرر گردیده است سازمان‌های مناطق آزاد تعداد ۲۱ خودرو (سازمان منطقه آزاد کیش ۱۲ دستگاه، چابهار ۶ دستگاه و اروند ۳ دستگاه را به نهاد ریاست‌جمهوری واگذار کنند، اما از آنجا که قصد استفاده دیگری مطرح بوده و احتمال می‌داده است که واگذاری‌های فوق پس از استقرار دولت جدید لغو شود با بهره‌برداری از مصوبه پیش گفته شده، تفاهم‌نامه‌ای از سوی موسسه خانه ایرانیان با سازمان‌های مناطق آزاد منعقد و به بهانه آن تعداد زیادی خودرو به موسسه خانه ایرانیان واگذار شده است.