کفاشیان در آخرین روز ثبت‌نام انتخابات دو بار به سازمان بازرسی کل کشور رفت تا برای حضور در انتخابات مجوز بگیرد. همچنین گفته شد که او در سازمان بازرسی تهدید شده است که به انتخابات ورود نکند. اما عضو هیات رئیسه فدراسیون فوتبال تاکید کرد که رئیس این فدراسیون برای عدم حضور در انتخابات تهدید نشده و تحت‌فشار هم نبوده است. به گزارش خبرگزاری تسنیم، شهرام دبیری گفت: «کفاشیان که چنین حرفی نزده و تهدید هم نشده است. جلسه‌ای بوده که به توافق و تعامل رسیدند تا اساسنامه به تایید و تصویب هیات دولت برسد. او داوطلبانه و بدون تحت‌فشار بودن خواست که در انتخابات نباشد.»