از روزی که نهاوندیان به عنوان رییس دفتر رییس‌جمهور انتخاب شد حرف و سخن‌هایی هم درباره ابقای وی در مقام ریاست اتاق ایران مطرح شد. با این حال نهاوندیان در جلسه‌ای از نمایندگان بخش خصوصی خواست که با بالا بردن دست که البته منتقدانی هم داشت، موافقت خود را با استعفا یا عدم استعفای وی اعلام کنند. اما ظاهرا با حمایت یک دست پارلمان بخش خصوصی در سمت خود ابقا شد تا هم رییسی برای اتاق بازرگانی باشد و هم رییسی برای دفتر رییس‌جمهور.