پس از آنکه هیات امنای دانشگاه آزاد اسلامی تصمیم به برکناری فرهاد دانشجو از ریاست این دانشگاه و واگذاری سرپرستی آن به میرزاده گرفت، برخی از اصولگرایان این اقدام هیات امنا را سیاسی قلمداد کردند. تا جایی‌که حدادعادل ضمن شتابزده خواندن این اقدام، تغییر رییس این دانشگاه را برای طراحان آن پشیمان کننده خواند. احمد توکلی هم خطاب به طرفداران دولت گفت شما که اندکی بیش از 50 درصد رای آورده اید به بهانه صدای اکثریت، نباید اراده سیاسی خود را بر اقلیتی که تقریبا به اندازه شما است تحمیل کنید.