زینب موسوی عضو گروه خبر سرانجام وزارت علوم با انتشار نتیجه بررسی‌هایش درباره بورسیه‌های غیرقانونی دولت قبل در قالب یک گزارش، ادعای مخالفان دولت مبنی‌بر بی‌اساس بودن این پرونده را رد کرد؛ پرونده‌ای که مخالفان آن، با انتشار جزئیات نیز زیر بار نرفته و از وزارت علوم خواستند از افرادی که تخلف نداشته‌اند، عذرخواهی کند؛ هرچند این خواسته با اظهارات قاطعانه نجفی مبنی‌بر اینکه «وزارت علوم از چه چیزی عذرخواهی کند؟» روبه‌رو شد. پرونده اعطای بورسیه‌های غیرقانونی در دولت قبل موضوعی است که هرچند با سکوت حامیان استیضاح رضا فرجی‌دانا، اولین وزیر علوم دولت یازدهم مواجه شد، اما رای منفی مجلسی‌ها به ابقای او بر کرسی وزارت، سبب نشد تا دولت به‌ویژه محمدعلی نجفی، از پیگیری آن سرباز زند؛ گویی نجفی تنها برای به نتیجه رساندن این پرونده به وزارت علوم آمده است.
همه این تلاش‌ها در شرایطی به سرانجام رسید که برخی از نمایندگان مجلس، با کوچک جلوه دادن این پرونده در تلاش بودند تا وزارت علوم را از ادامه پیگیری‌ها بازداشته یا دست کم نتایجی غیر از آنچه هم‌اکنون به دست آمده است، به افکار عمومی اعلام کنند. این موضوع را می‌توان از شاکله کمیته مجلس برای پیگیری بورسیه‌های غیرقانونی دریافت. این کمیته علاوه ‌بر آن که اعضای اغلب از موافقان استیضاح فرجی‌دانا بودند، به غیرقانونی بودن این بورسیه‌ها نیز اعتقادی نداشتند؛ نقاط ضعفی که شاید بیش از هرچیز کارکرد این کمیته را زیر سوال می‌برد. با این همه اما اهمیت انتشار نتایج بررسی این پرونده تا آنجاست که علی لاریجانی رئیس مجلس از وزارت علوم برای تهیه گزارش تخلفات در اعطای بورسیه‌ها تشکر کرد.