ایسنا- خاتمی در دیدار با وزیر و مدیران آموزش عالی دولت اصلاحات با تاکید بر اینکه «امروز بنایم بر این نیست که درکارها دخالت کنم» گفت: «در دوران مسوولیت، ما به حاکمیت یک جناح خاص نمی‌اندیشیدیم، بلکه حاکمیت یک رویکرد و تفکر برای پیشرفت و اعتلای کشور مورد نظر ما بود.» او همچنین افزود: «دعا می‌کنم که دوستان در دولت موفق شوند و انصافا گام های خوبی برداشته شده است، اما صمیمانه عرض می‌کنم که دولت باید مدد بگیرد از تجربه، دانش و به اصطلاح سرمایه‌ای که نیروهای خیرخواه جامعه‌اند. اگر بنا بود مشاوره به جناب آقای دکتر روحانی بدهم، می‌گفتم جمع را در عرصه آموزش عالی، علم و فناوری و مدیریت آن طرف مشورت قرار دهند. نه اینکه کسان دیگری شایسته نیستند، اما این دوستان کسانی‌اند که در مدیریت آموزش عالی صاحب‌نظر و تجربه‌اند و خیرخواه هستند.» خاتمی همچنین یادآور شد: «منظور از آزادی، آزاد اندیشیدن و با امنیت اندیشیدن و آن‌را بیان کردن و به تبادل اندیشه و آگاهی پرداختن است؛ در این صورت است که انسان و جامعه کمال پیدا می‌کند و خوددانایی افزایش می‌یابد و نقص‌ها از بین می‌رود و در دانشگاه باید شاهد چنین وضعیتی باشیم و اگر نبود ما بزرگ‌ترین شرط تحقق دانشگاه و محیط‌های علمی و اندیشه‌ای را فاقد هستیم.»