با آنکه رییس‌جمهور از وزیر علوم خواسته روسای دانشگاه‌های تهران و تربیت مدرس را برکنار کند، فرهاد رهبر و بیژن رنجبر همچنان مشغول کارند. کامران دانشجو، وزیر علوم می‌گوید: نامه مربوط به برکناری این دو را در اول بهمن سال گذشته دریافت کرده و راجع به آن با رییس‌جمهور نیز صحبت کرده، اما پس از آن دستور جدیدی در این باره از سوی محمود احمدی‌نژاد صادر نشده است. رییس‌جمهور «رویکرد سیاست‌زده و غیرعلمی یا احیانا امنیتی» در این دانشگاه‌ها را به عنوان دلایل برکناری روسای آنها اعلام کرده بود.