در متن پیام رهبر انقلاب اسلامی آمده است: «درگذشت عالم پرهیزگار و معلم اخلاق جناب حجه‌الاسلام آقای حاج سیدعلی‌اکبر حسینی‌موسوی رحمه‌الله‌علیه را به خاندان گرامی و فرزندان محترم و دیگر بازماندگان و نیز به شاگردان و ارادتمندان ایشان تسلیت عرض می‌کنم. خدمات ارزنده این روحانی با اخلاص و پر تلاش چه در آموزش‌های سودمند در رسانه ملی و چه در مجلس شورای اسلامی و چه در محیط مسجد و محراب، معرف چهره نورانی یک عالم خدمتگزار و با ابتکار است. از خداوند متعال علو درجات آن مرحوم و رحمت و مغفرت الهی برای ایشان و صبر و اجر برای بازماندگانشان مسألت می‌کنم.»