سرانجام تکلیف یکی از صندلی‌های ریاستی آیت‌الله هاشمی رفسنجانی با حکم رهبری مشخص شد و ایشان با صدور حکمی علی‌اکبر ولایتی را به‌عنوان رئیس هیات موسس دانشگاه آزاد منصوب کردند. این در حالی است که هنوز جانشین آیت‌الله در مجمع تشخیص مصلحت نظام و نیز مجلس خبرگان مشخص نشده که اولی نیازمند حکم رهبری و دیگری نیازمند برگزاری انتخابات است. در همین حال اولین جلسه کمیسیون نظارت مجمع تشخیص مصلحت نظام بر حُسن اجرای سیاست‌های کلی به ریاست محسن رضایی تشکیل شد.